Mouri explicó que sus dos hijas solían pelearse por controlar a Peach en juegos anteriores de Mario. La incorporación de Daisy como personaje jugable en el título no solo pone fin a este conflicto en su propia casa, sino que también alegrará a muchos fanáticos de Mario.
Además de Daisy, Super Mario Bros. Wonder presenta otros personajes jugables diseñados para atraer a jugadores más jóvenes, como un grupo de Yoshis y Nabbit. Estos personajes no sufren daño al chocar contra enemigos, lo que facilita la jugabilidad para aquellos menos familiarizados con las mecánicas del juego. Sin embargo, aún pueden perder vidas si caen al vacío, lo que requiere precaución al realizar saltos.
El juego ha llamado la atención por su propuesta original y su estilo artístico colorido. La falta de fechas límite en la fase de desarrollo permitió a los creadores explorar diferentes ideas y seleccionar las más interesantes, sin tener que trabajar bajo presión.