El Fortafin fue creado en 2016.
La FGR investiga que el gobierno de Rubén Moreira en Coahuila, haya realizado gastos ilegales por más de 400 millones de pesos con recursos federales del Fortafin.
La investigación de la fiscalía anticorrupción de la FGR incluye también a Antonio Zerón Puga y Nazario Salvador Iga Torre, quien también trabajó en la misma Secretaría como Director General y Director de Adquisiciones.
El Fortafin fue creado en 2016 en sustitución del Programa de Contingencias Económicas para atender las solicitudes de los Gobiernos Estatales y Municipios.
La ASF señaló en un informe de fiscalización de la Cuenta Pública 2017, que el Fortafin carecía de reglas de operación y lineamientos para indicar su objetivo y los beneficiarios a los que estaba dirigido.